Một số nơi như gò miếu Bà - Bến Đình, xã Tiên Thuận hay Thành bảo Long Giang, có nhiều ý kiến cử tri phản ánh, trong đó nổi lên ý kiến cần xác định lại phạm vi khoanh vùng bảo vệ di tích; bảo đảm không ảnh hưởng nhiều đến quyền và lợi ích hợp pháp của các hộ dân sống kề bên các di tích.
Trong số hơn 110 di chỉ còn lại, không phải nơi nào cũng có các đình, chùa, miếu mạo dân gian bảo vệ. Cũng không phải nơi nào cũng có những ngôi miễu nhỏ do người dân tín ngưỡng lập nên để giữ gìn, tránh kẻ gian xâm phạm.