Khu kinh tế cửa khẩu Mộc Bài được thành lập theo Quyết định số 210/1998/QĐ-TTg ngày 27.10.1998 của Thủ tướng Chính phủ, bao gồm thị trấn Bến Cầu, 4 xã Lợi Thuận, Long Thuận, Tiên Thuận, An Thạnh thuộc huyện Bến Cầu và 3 xã Phước Lưu, Bình Thạnh, Phước Chỉ thuộc huyện Trảng Bàng (nay là xã Phước Bình và Phước Chỉ thuộc thị xã Trảng Bàng). Toàn bộ diện tích tự nhiên khu kinh tế khoảng 21.284 ha (trong đó, diện tích thuộc huyện Bến Cầu là 13.156 ha, diện tích thuộc thị xã Trảng Bàng là 8.128 ha).